Die Welt wird weiterhin von den Attacken der Killertomaten bedroht. Der verrückte Professor forscht weiter in seinem Laboratorium und ist besessen von seiner Idee, durch mutierte Tomaten die Welt zu beherrschen. Unter Mithilfe von giftigen Industrieabwässern und Musik verwandelt der Professor Tomaten wahlweise in "Rambos", Bikinischönheiten oder was ihm sonst gerade so einfällt. Auch Tara, seine gutaussehende Assistentin, ist eine verwandelte Tomate. Buddy, der die selbstverständlich tomatenfreie Pizza seines Onkels auch in das Haus des Pofessors liefert, verliebt sich in Tara, ohne allerdings ihre Herkunft zu ahnen. Und damit beginnt der Wettlauf mit dem Killertomaten...